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使用fq文件去重脚本出现问题

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老师您好，我按照课程提供的流程泡自己的数据，在fst pi tajimaD分析的过程中，发现生成的曼哈顿图没有数据，在第一步的过程中，我们确实成功的生成了染色体对应的起始位置和pi值，但在pi多样性绘图输出时却发现没有数据，这是怎么回事呢，请老师帮忙解决

  • per 2024-06-21 16:37
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下载docker是出现这个问题

  • 李 2024-06-21 15:52
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老师 您看一下 这个是hic的测序方法

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老师，绘制PAV图时，结果如图，还有报错信息

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老师，下面是报错、染色体信息、gff文件中的染色体和命令行

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泛基因家族分析，提取CDS序列结果如图所示，并且文件大小只有38KB，是不是这个基因组就不能用了

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估算物种分化时间

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基因家族新版解压总是报错，无法获取更新后的脚本

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对于同一种系来源的生物体的基因组（比如都是人类的基因组），我要进行连锁不平衡分析，不同批次的数据对连锁位点的判断相同吗？

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5 stairway-plot里的mu（每代每位点的突变率）参数怎么确定？mu: assumed mutation rate per site per generation.

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5 stairway-plot里的L参数怎么确定？

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16S Picrust2

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老师 您说bwa比对哪里 能正常生成，就是在allhic对congtig分group那一步一直出错，我把bwa比对生成文件截图放后面了 老师您看一下

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在用gemma分析gwas时，调用perl脚本中的sort_trait.pl，发生报错，请老师帮忙解答，谢谢老师。

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WGCNA样本必须至少15个吗？

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老师，我在做不同物种共线性分析的时候，配置文件的过程中出现如下错误，刚开始是按照视频教学的复制文件过来用，后来报了这个错，就从头配置白菜基因组文件，但是还是报一样的错，想问问怎么解决？

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已知一个基因家族有多个亚家族，在做进化树时，如何在进化树中将各个亚族区分开？

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两个的内存都加啦 但是还是出现和上次一样的错误结果

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docker运行qiime2报错