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老师好，我在CALLSNP变异过滤时报错有几万行相同的错误。

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我在进行变异结果质控过滤，去掉低质量的变异结果发现我材料的变异结果都是0

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运行eggnog_stat.r报错

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想知道这两个图的截取长度分别为多少，如何判断的？

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老师 为什么我进行nextdenovo组装完成后，在03.ctg_graph文件中没有nd.asm.fasta文件呀

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你好 我看到你提出的问题 基因组染色体共线性分析出现 Unable to run 'false OUTFig.gp', Inappropriate ioctl for device 我在使用mummerplot也遇到了相同的问题 如果你解决了遇到的问题 是否可以分享一下你的解决方法 感谢

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老师，我在用GSDS绘制顺势原件作用图的时候，只显示一部分基因的顺式作用元件，另一部分只有CDS。我试过单独贴每一个基因，是可以的。这种情况该怎么办？（ID检查过了，也更换浏览器，都不行）

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在执行命令的时候，遇到软件需要更新版本，怎么处理，

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关于annover建库问题

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Error running system command: </biosoft/annovar/2018Apr16/table_annovar.pl /work/my_reseq/5.var_ann/snp.avinput /work/my_reseq/ref -buildver unknown -outfile /work/my_reseq/5.var_ann/snp -remove -protocol refGene -operation g -nastring . -otherinfo>

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在T2T基因组直播课程中第八步根据参考基因组挂载染色体，共线性图出来后在这怎么操作得到最后的基因组染色体版本？

  • Song 2024-04-22 14:18
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16S扩增子分析中聚类分析出现问题。

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不同组扩增子数据长度差距太大，如果一起分析是不是结果不太好，分别分析然后编程整理是不是比较好一点，还是舍弃差距过大的数据呢？

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线粒体基因组问题

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在组装线粒体时日志文件显示出现了如下的错误请问是什么原因呢

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3 老师好，我用自己的数据根据参考基因组挂在染色体这一步，最后画共线性图报错，麻烦老师看一下

  • Song 2024-04-20 18:24
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JGI下载的文件，哪个是基因组文件和gff文件呢

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5 gwas分析tassel软件GUI界面PCA文件，表型，和hapmap文件合不起来

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plink怎么设置样本的PPID，MID，Sex信息？

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LDdecay衰减距离如何确定？