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36 泛基因家族分析之Fam_gene.list

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老师，我每次做“提取可靠基因家族成员的结构域序列”，提取出来的基因就变成了一个，之前正常的例如WRKYgene.pep.fa也相应变为一个了，请问老师，是我WRKYgene.list文件有问题么？但是生成pep是正常的

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老师，这个筛选步骤每个基因组只有一个基因，后面提取可靠基因家族成员的蛋白全长序列正常，提取可靠基因家族成员的结构域序列这一步也是只有一个，是我前面的步骤出错了么，筛选前还一切正常，

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老师请问，怎么把这些文件像您一样做成一个文件在数据库里确认结构域

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共线性分析进行blast+比对，输出屏幕出现waring，这是啥意思啊?影响比对结果吗？最后能输出blast文件

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tgsgapcloser报错

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为挂载到染色体上的基因家族成员能否绘制基因在染色体上的定位图？

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为挂载到染色体上的基因家族成员能否绘制基因在染色体上的定位图？

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RNA-SEQ分析中，基因ID位于Chr01-Chr09的基因的reads数目全部是0

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进化树+motif+基因结构三个一起显示报错

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老师，我正在做泛基因家族分析中结构变异与基因结构和保守结构域分析，

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我改正了这些错误，但是还是无法把data里的数据软连接道01 data prepare上，不知道哪里出错了，基因文件和gff文件没有问题

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参考基因组建立索引报错，这是什么原因？

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泛基因家族分析

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请问老师，我重新修改了软链接，但是基因组序列文件和注释文件批量链接还是出错，为红色

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请问老师，我已经成功在docker挂载我自己的基因组文件了，和01dataprepare前几个步骤一模一样，但是最后链接到01dataprepare的文件还是红色的无法打开

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泛基因家族分析

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请问老师，泛基因家族鉴定开始做自己的物种时，怎么在docker 里上传自己需要做的物种的数据

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string数据库

  • 2025-05-28 09:09
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蛋白互作分析，Orthovenn3选择内容太多，不知道选啥？