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blast比对之后

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GSDS网址定位问题

  • 大k 2020-04-25 22:28
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请问提取基因CDS位置时，用蛋白序列ID（NP开头）无法提取，但是用mRNAID（NM）可以提取？

  • 大k 2020-04-25 22:21
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基因家族鉴定

  • Jan. 2020-04-25 18:54
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Can't open perl script "script/get_fa_by_id.pl": No such file or directory 老师请问这是什么原因呢？

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老师好，请问在做McscanX分析时，从gff提取的geneID与pep.fa文件的ID不一样，无法提取出蛋白序列，那怎么办？

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MAGE建树问题

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NJ法和ML法建树大大不同

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3 结构域建树

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请问这两个基因ID不同是有什么区别吗？在后面做筛选的时候，就只能出来基因ID短的，这些基因ID长的筛不出来的原因是什么呢？希望可以回复下

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老师，麻烦问一下制作基因结构图时，gene_exon_info.gff文件始终为空的，

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想请问一下老师，出现这个怎么解决？

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老师好，有关blastall参数的问题！

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请问老师，如果想做某个基因家族在不同物种之间的进化树怎么做，基因数量太多，无法构建基因的进化，应该如何构建物种进化呢？？

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老师你好，我用HMM鉴定马铃薯PPR家族成员时出现了问题，如下图，请问是什么原因导致的

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20 老师，请问做基因上游顺式元件分析时，只有cds文件，gff文件和pep文件，该怎么提取promoter序列

1 解决

手动分析跟MCSanx分析出来串联重复基因一样吗

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20 老师，请问做基因上游顺式元件分析时，只有cds文件，gff文件和pep文件，该如何提取promoter序列

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10 老师，请问只有gff文件，cds文件和pep文件，该如何做基因上游顺式元件分析

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在GSDS获得基因结构图时，我的gff文件里有40条，结果图上只有五条，是怎么回事呢？