2 解决

MCScan(jcvi) 生成anchors文件大小为0

  • 2020-05-12 13:37
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老师，可以出一个顺式作用元件提取时基因组太大，把基因组拆分成不同染色体的代码吗？

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物种基因组只有scaffold水平，可以做染色体分析吗

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老师，您好。我想请问为什么我在NCBI搜某一基因mRNA和蛋白质序列，点击NM和NP他们属于不同家族呢？

  • 2020-05-11 13:24
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基因家族分析Ka/Ks时，在把aln文件转换成axt文件时，运行Linux命令遇到no such file or directory该怎么解决

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共线性分析之前提取的蛋白质序列为空。如何解决？

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老师你好，我是从NCBI下载的GFF文件，在做基因结构分析的时候，UTR没有标注，只能提取出来CDS区域，请问如何添加UTR区呢？

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请教：基因结构分析时，输出的gene_exon_info.gff文件为空。该如何解决？

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10 老师，您好，请问一下Urate oxidase的pfam号是什么呢？我感觉我找的不对

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绘制基因在染色体上的位置图时，需要怎么做才能找到基因簇

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老师，我用mcscanX分析出Segmental之后，计算KAKS

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如何查找一个基因家族的结构域呀？

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5 基因家族鉴定

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10 亚细胞定位的site定位在extr secreted是指什么啊

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比较基因组共线性作图疑问

  • Iron 2020-04-30 10:08
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怎么利用公开的转录组做基因家族的表达分析，还有GEO和SRA的区别是什么？

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请问：在做基因家族分析时，只有基因组的fna，和gbff文件，怎么找它的cds和pep呢

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对基因家族里面所有的成员进行kaks计算，而不仅对串联重复基因进行kaks计算有意义吗？

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老师，可不可以把整个基因家族全部基因的算KA ks，计算选择压力

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5 做基因组间共线性时用下面这个命令进行过滤，我想问一下这个命令在写文章的时候怎么描述呢？