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t2t基因组，转录组数据注释
两个策略，一个是不同的转录组都做注释，然后做合并；第二种也是大部分文献里会采取的，把不同的转录组数据combine之后做一次注释。如果选择第二种，则需要在原始数据的.gz做合并。
回答于 2025-10-09 09:50
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你好老师，我05以后的脚本在rstudio server 突然打不开应该怎么...
针对第一个问题，可能是因为你的文件夹被删除或者改名字了，所以在原来文件夹路径试图打开文件会显示不存在。选择这里的刷新看看，如果刷新弹出报错，选择退回真实存在的文件夹，重新进入。针对第二个问题，我这边进入是没有问题的，你看看自己的网络和网址：http://cloud.omicsclass.com:8010，以及自己账户是否还在有效期...
回答于 2025-09-30 10:40
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PSMC分析
可能的原因有：1. 数据量不足，如果数据量太少（低覆盖度这种）PSMC可能无法检测到有效信号。vcfutils.pl vcf2fq -d 10 -D 100这一步做了深度过滤，如果测序深度不够的话需根据实际覆盖度调整。psmc.fa文件内容需要包含足够的杂合位点。2. 参数设置不当，PSMC的参数（ -t、-r、-p）对结果影响很大，不合理的参数可能导...
回答于 2025-09-25 10:22
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dadi 分析
参数意义与使用参考：dadi实例解读参考：Molecular Ecology | Molecular Genetics Journal | Wiley Online Librarym12表示群体1到群体2的交流，m21同理。
回答于 2025-09-19 15:02
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用GenotypeGVCFs合并不同种质的g.vcf文件
是head部分染色体顺序也这样还是变异部分的顺序？如果只是变异之后的顺序，可以在生成完了vcf之后单独用Picard SortVcf或者其他软件做一下排序工作。
回答于 2025-09-19 13:34