158 个回答
将基因组文件和gff文件批量链接到当前文件夹时，文件名出现问号...
红色失败表示在你软连接的绝对路径下面没有这个文件，需要你提供/work/my_pan-gene-family/data/下面得截图。在容器下面操作： l /work/my_pan-gene-family/data/
回答于 6天前
我的初始vcf文件60GB,经过三次过滤最终clean.vcf文件只有1.1MB，...
maf降低、maxmissing降低、minGQ降低，以及等位基因数目不限制那么死就可以增加可用位点。
回答于 2026-04-28 10:30
使用docker 镜像中的plink软件跑PCA Admixture 分析时都遇到以下...
这个是plink 1.9会出现的 ，自己升级到2.0就没事了。其实并没有真实的错误，可以看结果文件，也是全的。直接往下进行就可以了。
回答于 2026-04-22 10:05
有没有GWAS做之前的表型数据一致性分析教程
分析正态分布、方差齐性和差异显著性？Graphpad和SPSS都可以做技巧（4）——GraphPad进行单因素方差分析与多重比较 - 知乎
回答于 2026-04-10 10:21
老师我排查问题发现ALLHiC_partition这一步只能生成一个txt文件
“更改了酶切位点改为2以后能生成11个文件，得到的热图....”这个最下面的热图不是蛮正常的吗？标度尺也是正常的。然后你的groups.hic.heatmap的文件夹里面还有一个500K_all_chrs.pdf，那个图里面有几个小图？是11个吗？我不知道你的k设置的是多少？是11吗？
回答于 2026-03-19 16:36
geneflow
你的树每个节点的高度都完全不同且单调递增，DFOIL_Picker_mod_noEdge.R 对于每个节点又只考虑高度大于或等于当前节点高度的其他节点（脚本133行）。这就导致在进行组合的时候，每个节点要么没有足够高的其他节点，要么符合条件的节点都是自己的后代而被排除。所以没结果是树形导致的。要么把70行注释掉不用。或者62行注释...
回答于 2026-03-18 10:42
conda
直接which conda之后找到conda所在文件夹，删除这个文件夹就行了。记得删除配置文件 .bash_profile中关于conda的内容或者你参考这个
回答于 2026-03-16 11:14
GWAS获得显著位点如何去设计分子标记？
一般会通过第一种方法“通过结合表型值判断不同基因型是否存在显著差异”。“优势单倍型”是指引起表型变化的还是指占比最高的单倍型，如果是占比最高的，那设计标记进行分型得目的和表型怎么关联呢？
回答于 2026-03-16 11:11