chrorder调整的时候染色体条数发生改变了。不做这一步直接根据之前的delta和coords文件做syri。但是可能存在大结构变异也会导致call变异失败
在使用mummer比对后利用syri进行SV检测时报错
nucme比对后生成out.delta文件,delta-filter和show-coords对结果进行过滤并生成表格,生成out.1coords文件,chrorder进行链方向调整后query.genome.fa染色体丢失,后续的SYRI报错。
syri报错:Reading Coords - WARNING - Chromosomes IDs do not match.
Reading Coords - ERROR - Unequal number of chromosomes in the genomes. Exiting