5 mummer比对syri进行SV检测报错

在使用mummer比对后利用syri进行SV检测时报错

nucme比对后生成out.delta文件,delta-filter和show-coords对结果进行过滤并生成表格,生成out.1coords文件,chrorder进行链方向调整后query.genome.fa染色体丢失,后续的SYRI报错。


syri报错:Reading Coords - WARNING - Chromosomes IDs do not match.

Reading Coords - ERROR - Unequal number of chromosomes in the genomes. Exiting


out.anno


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  • 李昂 提出于 2天前

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