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移动的时候用通配符显示找不到文件 但列出文件夹里有
1.检查是否有不可见字符或者复制粘贴问题2. 确认通配符是否展开echo /work/T2T-demo/08.1.ChromSyn/ragtag.scaffold.*
回答于 2026-08-31 10:18
LD结果原始数据如何看
“LD.p.”是你自己给的输出文件前缀*.TriangleV.gz 区域内成对的 R^2/D’计算结果LD.p.site.gz 过滤后剩余的进入计算的 SNPsR ，第一列是chr ，第二列是site（snp所在位置）你说的LD区块分成两个意思，一个是根据LD衰减图确定LD block大小，在候选SNP左右两侧延申一个LD block所形成的。一个是 在LDBlockShow结果中联系紧密的S...
回答于 2026-08-31 10:01
泛基因组
他主要是基于web提供的可视化服务，使用参考这个：图形泛基因组可视化 - 组学大讲堂问答社区本地使用参考：GitHub - vgteam/sequenceTubeMap: displays multiple genomic sequences in the form of a tube map · GitHub
回答于 2026-08-05 16:26
nt 数据库
这个库比较大，我们无法通过网盘进行提供，下载和配置可以参考这个帖子：https://blog.csdn.net/m0_67672416/article/details/160833086我们网站上也有下载和拆分的教程：按物种拆分blast本地库 - 组学大讲堂问答社区
回答于 2026-08-03 11:20
hic数据和rnaseq数据是否可以进行snpcalling并进行群体分析
技术上都可以做 SNP calling，但都不推荐作为群体分析的主力数据。hic需要仅保留valid pair
回答于 2026-07-27 13:57
质控
说明目前过滤标准对你的数据来说太严格了，目前过滤标准为： --maf 0.05 --max-missing 0.7 --minDP 3 --maxDP 1000 --minQ 30 --minGQ 30 --min-alleles 2 --max-alleles 2 1. 如果你测序深度低，删除这个参数：--minDP 32. 如果不是二倍体，删掉这个--min-alleles 2 --max-alleles 23. 如果样本多样性差，下调--maf 0.05...
回答于 2026-07-21 17:08
老师您帮忙看一下 就是我在做cafe分析的时候 这个我删掉一个...
Orthogroup.GeneCount.cafe.tsv.new需要检查，主要是检查Cocos_nucifera这个物种所在列是否全部为空
回答于 2026-07-06 15:46