Ti Amo
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153 个回答

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dadi

检查输入文件./NorthAfrica-Yourawildgoat.sfs是不是有一行全是0。easySFS.py里面投影值设置根据自己样本数目进行更改

回答于 2025-09-15 16:35

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请问我在做GWAS性状绘图时出现以下报错,我的数据格式该怎样修改...

很可能表型数据格式不符合标准。可以给出表型数据截图、写明自己操作命令以及报错。

回答于 2025-09-15 13:41

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老师想问一下,为什么我在myt2t文件下面创建,但是最后跑去了家...

变量workdir没赋值。export workdir=/work/myt2t

回答于 2025-09-15 13:40

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dadi分析

问题出现在coding_change.pl脚本的,77行存在一个正则表达的匹配要求: $field[2] =~ m/^[\w\-\.\@\/]+?:([\w\.]+?):exon\d+:c.([\w\->]+)(:p.([\w\*]+))?/ or die "Error: invalid record found in exonic_variant_function fi在这一行上要求第三列的的第二部分(也就是rna名字)是([\w\.]+?)这个范围内的东西,而你的...

回答于 2025-09-11 18:01

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基因组过大,能不能分割基因组做重复序列注释

可以这样加速,切割部分的注释结果可能需要重新做一下

回答于 2025-09-11 10:01

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docker 安装

参考【docker安装】由于没有公钥,无法验证下列签名: NO_PUBKEY 7EA0A9C3F273FCD8-CSDN博客

回答于 2025-09-10 16:06

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请问一下老师,在大讲堂学习的时候用的是docker+Linux系统,但...

虚拟机里面是linux系统的话使用起来没差别。压缩包上传到指定位置,然后docker load -i 加载压缩包就行了

回答于 2025-09-10 13:18

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tgsgapcloser 如何控制minimap占用的内存

一般内存不够推出都是在minimap2这个地方,可以设置minimap2的比对参数。可以增减--minmap_arg '-f 0.1',-f的意思是通过移除高频出现的重复性 minimizer(最小哈希值),来减少重复序列对计算过程的干扰

回答于 2025-09-09 10:59

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da

参考一下这个的解决方法:annovar报错终于解决,Erro: invalid record found in exonic_variant_function file (exonic format error),泪目-CSDN博客

回答于 2025-09-08 10:46

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我让生物公司测一个莱甲的基因组,挂载的时候他们挂载6条染色体...

这个是比较正常的。13条染色体中包含了大量的小染色体,这些小染色体由于尺寸小、数据点少,其Hi-C热图固有的结构清晰度就是不如大的染色体。目标不是让13号染色体看起来和6号一样“好”,而是优化整体13张图的展示效果,并从分析中获取有效信息。1.​​计算全局指标进行客观比较​,而不是只看热图。 2.为每条染色体单独优化​...

回答于 2025-09-08 10:32