检查输入文件./NorthAfrica-Yourawildgoat.sfs是不是有一行全是0。easySFS.py里面投影值设置根据自己样本数目进行更改
回答于 2025-09-15 16:35
问题出现在coding_change.pl脚本的,77行存在一个正则表达的匹配要求: $field[2] =~ m/^[\w\-\.\@\/]+?:([\w\.]+?):exon\d+:c.([\w\->]+)(:p.([\w\*]+))?/ or die "Error: invalid record found in exonic_variant_function fi在这一行上要求第三列的的第二部分(也就是rna名字)是([\w\.]+?)这个范围内的东西,而你的...
回答于 2025-09-11 18:01
虚拟机里面是linux系统的话使用起来没差别。压缩包上传到指定位置,然后docker load -i 加载压缩包就行了
回答于 2025-09-10 13:18
一般内存不够推出都是在minimap2这个地方,可以设置minimap2的比对参数。可以增减--minmap_arg '-f 0.1',-f的意思是通过移除高频出现的重复性 minimizer(最小哈希值),来减少重复序列对计算过程的干扰
回答于 2025-09-09 10:59
参考一下这个的解决方法:annovar报错终于解决,Erro: invalid record found in exonic_variant_function file (exonic format error),泪目-CSDN博客
回答于 2025-09-08 10:46
这个是比较正常的。13条染色体中包含了大量的小染色体,这些小染色体由于尺寸小、数据点少,其Hi-C热图固有的结构清晰度就是不如大的染色体。目标不是让13号染色体看起来和6号一样“好”,而是优化整体13张图的展示效果,并从分析中获取有效信息。1.计算全局指标进行客观比较,而不是只看热图。 2.为每条染色体单独优化...
回答于 2025-09-08 10:32