老师，您好，最近做的bHLH转录因子的文章，我做序列比对的时候需要先知道它有几个亚家族吗是要从亚家族里边找出来几个氨基酸序列进行比对，怎么确认水稻和拟南芥属于这个亚家族，还是把物种的所有序列都比对，比如，拟南芥有二百多条，水稻有一百多条等，谢谢您 - 组学大讲堂问答社区

老师，您好，最近做的bHLH转录因子的文章，我做序列比对的时候需要先知道它有几个亚家族吗是要从亚家族里边找出来几个氨基酸序列进行比对，怎么确认水稻和拟南芥属于这个亚家族，还是把物种的所有序列都比对，比如，拟南芥有二百多条，水稻有一百多条等，谢谢您

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分类：基因家族分析

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omicsgene - 生物信息 2020-04-16 17:26

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

可以使用hmmersearch 批量鉴定哪些基因为bHLH 转录因子；至于这这个基因的特点你需要阅读相关文献了解一下；

想分析基因家族可以学习课程：学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读

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spring rain 提出于 2020-04-16 03:29