perl的Config::General 这个包没安装,你需要安装一下,在我们提供的biolinux上是有这个包的; 如果不想安装,请下载安装我们提供的biolinux:https://www.omicsclass.com/question/291 一点建议: 截图不要吝啬,尽量大,尽量多的提供信息,才好回答你的问题。附图之后,再复制粘贴一下文字就更好了;
回答于 2018-09-28 17:55
1.仔细看第一节ppt参考资料下载方法: 2.我们课程中用的文件都在参照资料当中,如下图所示: scripts文件夹可以自己建立,然后把下载好的perl脚本放进去就好,kaks也是一样的;
回答于 2018-09-27 21:26
OMIM uses genomic reference build GRCh38 available at ftp://ftp.ncbi.nih.gov/gene/DATA/gene2refseq.gz. If you wish to get genomic coordinates for GRCh37/hg19, that data is available from NCBI at ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov//genomes/H_sapiens/ARCHIVE/ANNOTATION_RELEASE.105/GFF/ref_GRCh37.p13_top_leve...
回答于 2018-09-27 14:50
可能在建共享目录的时候哪里设置不对:你按照这个文章检查一下:https://www.omicsclass.com/article/260
回答于 2018-09-25 22:17
这里的用法是perl的正则表达式捕获功能,你的ID里面没有“:” 所以这里出错了,把这个冒号删除试试; 建议学习一下perl《perl入门》《perl高级编程》 perl高级编程里面有正则表达式的详细教程;
回答于 2018-09-25 10:42
没有基因组,可以做无参转录组对转录本进行拼接,就可以得到转录本序列,然后做基因家族鉴定。 二代测序,或者三代测序都是可以的。
回答于 2018-09-22 17:22