可能在建共享目录的时候哪里设置不对:你按照这个文章检查一下:https://www.omicsclass.com/article/260
回答于 2018-09-25 22:17
这里的用法是perl的正则表达式捕获功能,你的ID里面没有“:” 所以这里出错了,把这个冒号删除试试; 建议学习一下perl《perl入门》《perl高级编程》 perl高级编程里面有正则表达式的详细教程;
回答于 2018-09-25 10:42
没有基因组,可以做无参转录组对转录本进行拼接,就可以得到转录本序列,然后做基因家族鉴定。 二代测序,或者三代测序都是可以的。
回答于 2018-09-22 17:22
ova文件存放的目录路径当中不要有中文试一下。 或者参考:https://www.omicsclass.com/article/426
回答于 2018-09-21 11:15
建议你学习一下这个课程:biolinux的虚拟机安装见视频课程:《Linux生信分析环境搭建Bio-linux》
回答于 2018-09-21 09:05
比较及共线性分析可以用一下MUMmer这个软件,专门做基因组比较的:http://mummer.sourceforge.net/ 不同物种的叶绿体,可以拿一些叶绿体比较保守的基因做做进化树分析,参照:https://www.omicsclass.com/article/226 , https://www.omicsclass.com/article/114 叶绿体基因组做的不多,不是很熟。
回答于 2018-09-20 10:17
A contig is a contiguous length of genomic sequence.A scaffold is composed of contigs and gaps. Gap length can be guessed by incorporating information from paired ends or mate pairs What is a Scaffold?A scaffold is a portion of the genome sequence reconstructed from end-sequenced whole-genome shotg...
回答于 2018-09-20 09:52