没有用过windows版本的hmm,可能是你的hmm软件没有安装成功,还有输入文件是不是有问题。 建议学习我们的课程:《基因家族分析视频课程》 里面有详细的使用说明。
回答于 2018-10-09 18:24
我的版本是:MUMmer3.23 需要对mummer添加参数重新编译: The size of your reference sequence is larger than is supported by default. You can either break your reference into multiple files and run each individually, or recompile the mummer package with: > make clean > make CPPFLAGS="-O3 -DSIXT...
回答于 2018-10-09 18:19
问题描述清楚,用了什么软件,做了什么操作,输入文件是什么?别人才好分析原因,才好回答你的问题。不然只能猜了,请完善一下问题。 如何重新编辑问题:https://www.omicsclass.com/question/325 问题描述示例:https://www.omicsclass.com/question/242
回答于 2018-10-09 12:00
不同的基因家族分类方法不一样,可以多看看文献看一下自己的这个基因家族在别的物种中怎么分析的,找找分析思路; https://www.omicsclass.com/article/459 一些基因家族文章;
回答于 2018-10-08 10:35
这个具体的结构域你得弄清楚,可能你的基因序列本身就没有连续的,自然就出不来那个图了; 或者你可以试一下选择 full result 显示试一下:https://www.omicsclass.com/article/310
回答于 2018-10-04 10:56
提取不出序列,你看看你基因的位置信息里面的第一列里面的序列ID,和你基因组的序列id是不是对应,搜索检查一下;
回答于 2018-10-02 19:19