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在MCScan目录下，做共线性分析时，遇到了permission denied，请...
MCScanX我们biolinux当中已经安装，请使用课程使用的路径运行MCScanX，自行安装的MCScanX，我这不好说错误原因； 权限问题，可以在命令行前面加sudo；
回答于 2018-11-02 19:23
串联重复基因必须是同一条染色体上的基因吗
串联重复基因当然是相同的染色体了：看看定义: https://www.omicsclass.com/question/1 blast分析的串联重复基因或者大片段复制基因，这个需要自己判断，如果在同一条染色体且距离小于100k时为串联重复；不同文献判断参数有差异；例如下文献： 参考文献：https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s128...
回答于 2018-11-01 21:33
使用circos的时候出现这种问题？求老师解答
建议重新下载我们提供的biolinux的ova包，免去安装的麻烦：路径：/biosoft/circos/circos-0.69-6/bin/circos 如果自行安装，参考：https://www.omicsclass.com/article/519 我们提供的biolinux下载地址：https://pan.baidu.com/s/1ui9ndOsjbtgHrJoxxOcTMQ
回答于 2018-11-01 13:09
请问在Linux中无法创建share文件夹怎么处理？求指导
你截图太少了，我没法给你看出原因；请仔细检查下windows目录名字是否设置正确，提前建立好；linux检查命令行拼写错误，linux下share目录要提前建立好；具体注意事项参考：https://www.omicsclass.com/article/260
回答于 2018-10-31 09:34
老师，分析基因的在染色体上的外显子，内含子，UTR位置信息时，
get_gene_exon_from_gff.pl 这个脚本直接从gff文件里面提取信息，你就别用gffread转换成gtf了，对你来说没用，忽略就行；我记得gffread这行已经注释了； 没用CDS的信息，你查看一下ID，信息对应关系，也就是输入提取的ID和GFF里面的CDS行对应的ID是否一致；
回答于 2018-10-31 09:22
黄老师，从转录因子数据库（http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn/）...
分析方法不同搜索出来的基因会有差异，这是正常的，不好评价准确性，这个需要比较才能知道。我只能说你可以详细看看各自是通过什么方法鉴定的。可以手动到NCBI的CDD，SMART等数据库再确认一下他们的准确性。
回答于 2018-10-30 17:03
64位的电脑装VirtualBox新导入的biolinux虚拟电脑都是32位的系统...
这是由于你的电脑的CPU虚拟化没有打开，参考下面文章在BIOS中打开一下： 可以参考这里：https://www.omicsclass.com/article/367 联想thinkpad虚拟化开启参考方法：https://jingyan.baidu.com/article/49711c6168a212fa441b7cf4.html
回答于 2018-10-30 16:49