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基因倍增后两个子基因的命运

首先你得找到基因之间的倍增关系,可以用基因组内共线性的方法发现倍增关系,但是,一个基因是不是lncRNA你需要鉴定一下,是否有编码功能都得鉴定。  基因组共线性分析可以参考:https://www.omicsclass.com/article/275

回答于 2018-11-24 12:21

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请问我在用MCScanX里面的例子的过程中出现这个问题,怎么解决呢

请安装MCScanX软件,再运行,参考: https://www.omicsclass.com/article/275 或者下载最新的biolinux,里面有安装好MCScanX: https://www.omicsclass.com/article/526 MCScanX做共线性分析,可观看视频:《基因家族分析实操课程》

回答于 2018-11-23 19:10

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基因结构分析

基因的ID 不对应,你看后面多.cds, .exon 等等,你可以用sed 删除一下再试一下;

回答于 2018-11-23 19:06

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在做基因家族分析时,画circos图的时候,只画出了一半,背景没有...

确定 检查路径了吗?  这里提示找不到文件,路径写错,注意绝对路径和相对路径; 你再检查一下;还有截图一定要截完整,图左边没截全;

回答于 2018-11-23 14:47

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家族分析序列提取后一个基因会有多条转录本,如何取舍?

选一个作为他的代表序列就可以了,参照:https://www.omicsclass.com/question/259

回答于 2018-11-23 12:48

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老师 我在做不同物种之间的共线性分析 最后出结果出图的时候出...

你运行的哪条命令?输入文件是什么?   给我的信息太少,我只能猜测,你检查你的相同物种的gff和bed 文件基因ID是否对应?  如果是绘图的话,检查最后两个配置文件输入文件是否写的正确;

回答于 2018-11-23 11:34

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老师,我的文本矩阵中已经全部是数值型数据了,没有NA的形式,在...

肯定有全0的,你再检查一下;

回答于 2018-11-22 11:45

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获取virtualbox com对象失败

可以照这个百度链接修改一下:https://jingyan.baidu.com/article/e9fb46e15b5e4f7521f766ae.html

回答于 2018-11-20 18:13

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预测基因家族成员的顺式作用元件,提取启动子序列失败

这里有两个 -in1 ,   linux基础不好注意认真仔细:

回答于 2018-11-20 15:30

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求大神指导如何安装Bio-linux系统,及在该系统下如何安装CG View...

biolinux虚拟机安装指南:https://www.omicsclass.com/article/526 没有生信背景,不会linux,即使软件安装了你也不会使用啊,所以先学习一下linux的使用。 软件的安装可以到软件官方网址查看官方的安装文档。

回答于 2018-11-20 09:46