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请问小麦基因家族分析电脑内存小，提取的文件是空的，这个问题解...
1.检查染色体ID 对应关系，不对应可能造成提取失败 2.小麦基因组巨大，在基因组上截取序列需要读入整个基因组，需要消耗很多电脑内存，如果电脑内存不足也会提取失败，因此，建议分染色体做：https://www.omicsclass.com/question/431 ， 或者升级电脑内存；
回答于 2018-11-09 11:58
circos图配置文件整理疑问
如果是要绘制基因家族共线性分析，类似下图，可将你截图中的<rules> </rules>之间的内容删除： 如果不删除就会得到下图结果，1号染色体和2号染色体条带颜色，4,5号染色体之间的条带颜色不一样：
回答于 2018-11-09 09:17
相近功能基因的检索方法的具体操作？？？
已知功能的基因库，例如NR库，将自己的基因序列与NR库比对（blastp），比对上的基因具有什么功能，那么我的基因也相似的功能。 NCBI上的blast工具就可以实现。
回答于 2018-11-08 11:28
关于隐马可夫文件的作用和构建。
可以到NCBI上的protein数据库下载相关功能的基因的蛋白序列，利用blastp在普通基因组当中去搜索鉴定，文献可参考： https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-018-4955-8 我们基因家族课程里面也有提到：《基因家族分析视频课程》
回答于 2018-11-08 11:21
不同物种间的共线性分析，如何配置simple文件，在图中标出红色
你贴图的这个文件（*simple）里面是基因组所有的共线性区域文件(拟南芥 vs 白菜）简化的，一行就是一对共线性区域。 所有基因的共线性关系，一一对应文件：*.anchors.new（详细版本区域内基因一一对应关系），可以在这个文件里面找到所有的拟南芥的WRKY（前面分析的）和白菜的WRKY基因（别人文献下载的）,对应关系给筛选出...
回答于 2018-11-08 10:06