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基因的共线性分析
MCScanX一般是做基因组之间的共线性，你9条序列做不了共线性。 你想找9条基因之间的关系，可先做不同物种的所有的共线性关系，然后看你的9条基因在不同物种之间是否存在共线性关系，也就是子集，可以类似做个这样的图： 共线性分析见：https://www.omicsclass.com/article/275
回答于 2018-12-03 09:42
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python中安装不上下载好的lastal的zip格式文件。输入命令输出为...
python版本的jcvi分析参考：https://www.omicsclass.com/article/284 基础不好，建议学习《基因家族分析实操课程》，里面最后有这部分视频课程。
回答于 2018-11-28 16:07
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黄老师您好，我想通过染色体的两两共线性分析，将杨树中的19条染...
你可以做一下MCScanX分析，然后把两两染色体的共线性结果挑出来，https://www.omicsclass.com/article/275 但是聚类没有做过，我不清楚
回答于 2018-11-28 16:05
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进化树构建
提问注意，不知道你说的是谁，怎么提取的MYB序列？ 序列差异较大，你仔细检查，是不是差异太大。继续删除GAP： https://www.omicsclass.com/article/221 如果差异太大，你可以截取myb结构域构建进化树； 搜索序列可参考：https://www.omicsclass.com/article/553 或者： https://www.omicsclass.com/article/50
回答于 2018-11-28 10:40
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