30 我共线比对结果就这么点是为什么

############### Parameters ###############
# MATCH_SCORE: 50
# MATCH_SIZE: 5
# GAP_PENALTY: -1
# OVERLAP_WINDOW: 5
# E_VALUE: 1e-05
# MAX GAPS: 25
############### Statistics ###############
# Number of collinear genes: 12, Percentage: 0.05
# Number of all genes: 23995
##########################################
## Alignment 0: score=277.0 e_value=0 N=6 NW_014685782.1&NW_014685782.1 minus
  0-  0: XP_014782229.1 XP_014782224.1  1e-155
  0-  1: XP_014782230.1 XP_014782223.1  8e-139
  0-  2: XP_014782226.1 XP_014782216.1  3e-133
  0-  3: XP_014782240.1 XP_014782213.1  1e-127
  0-  4: XP_014782190.1 XP_014782206.1       0
  0-  5: XP_014782194.1 XP_014782201.1       0

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2 个回答

Gbolin

blast结果有多少行?

八成是你的基因位置文件有问题,再看一眼ID 都对应吗?

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omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

检查基因位置信息gff文件是否有问题,对应情况;

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  • 陈塘关山渣 提出于 2018-12-11 10:58

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