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4143 个回答

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老师,我想问一下共线性分析时family.txt中的染色体实例上是at1,...

这个文件存储的基因组中染色体的编号,你自己可以查看一下你研究物种的基因组编号,基因组fasta文件里面有,不能自己编;

回答于 2018-12-13 21:04

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老师您好,我发现基因家族课程里共线性分析只有基因组内的分析,...

《基因家族分析实操课程》里面已经更新了比较基因组分析的内容:

回答于 2018-12-13 21:01

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我共线比对结果就这么点是为什么

检查基因位置信息gff文件是否有问题,对应情况;

回答于 2018-12-13 08:58

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利用hmmer软件鉴定基因家族成员,用的1e-20搜索,没有找到相应的...

首先确定自己的命令行输入是否有错,如果没错,可能本身就是没有;

回答于 2018-12-12 16:13

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请问一下在circos官网怎么找到这种图片的配置文件

别人发布的图,circos官网是没有专门针对这张图的配置文件,你需要自己编写配置文件,才能画出类似的图; 

回答于 2018-12-12 16:05

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老师好,通过拟南芥蛋白序列获得的隐马尔科夫模型文件可以用在别...

可以的,隐马尔科夫模型本身就是公用的;

回答于 2018-12-12 16:04

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meme中motif site和scanned site

没有看到文件,不好分析原因;

回答于 2018-12-12 16:02

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MCSCANX共线性图代码报错

看你的报错信息,请检查输入文件路径是否写错。

回答于 2018-12-12 16:01

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perl双层哈希赋值

这个地方为什么要用两层hash?? 一层hash,存储一下ID就好了,存储数字没有用;    还有, 读取文件最好用while循环,参考脚本:https://www.omicsclass.com/article/322

回答于 2018-12-11 14:14

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共线性 做blast时e值是否固定的

这个可以自行调节,可阅读其他参考文献。

回答于 2018-12-11 11:07