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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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4105 个回答

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做树时出现下述问题

序列差异太大:https://www.omicsclass.com/article/221

回答于 2018-12-06 20:48

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get_gtf.pl 脚本修改请教

尽量不要在NCBI上下载参考基因组,里面的编号NCBI会重新编码,你看看你物种参考基因组的文章,一般发布了基因组都会建立物种专有的基因组网站,你对应自己的物种去专用网站下载; 如果一定要用,可参考这个脚本将GFF文件修改一下,在网下进行分析:https://www.omicsclass.com/article/566 你的ID号和CDS的ID好不对应,所...

回答于 2018-12-06 11:53

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我在Rstudio上安装R包出现了图片上的问题,无法正常安装,应该怎...

R 包的安装方法有很多种你看一下:https://www.omicsclass.com/article/106

回答于 2018-12-05 17:23

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一个基因下面有两个预测蛋白怎么办

一个基因有不同的转录本,你这个应该是不同的转录本转录的蛋白质,做进化树选一个代表序列就好;

回答于 2018-12-05 17:22

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我想问一下用HemI 作图时输出的像素大概怎样调整才合适,我的输...

绘图输出尽量大一些,可参考文章投稿要求设置图片输出:https://www.omicsclass.com/article/330

回答于 2018-12-05 14:12

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请问GWAS分析中的D-block图有人会做吗?

课程里面有绘图: GWAS关联分析课程推荐:https://bdtcd.xetslk.com/s/2KgXQq

回答于 2018-12-04 17:42

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请问做有关小麦基因家族分析,计算分歧时间时T=Ks/2λ,这个λ该是...

分歧时间可以用kakscalculate 软件 计算,你说的这个公式不太懂; 更多见:《基因家族视频课程》

回答于 2018-12-04 10:07

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什么是参考基因组

相同的种才能做参考基因组,不同种差异很大,不建议做参考基因组。

回答于 2018-12-04 10:04

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老师,我看着网上您给的网站里的方法已经改了,可是还是有点问题...

我们最新版本的biolinux已经安装好了 MCScanX  在/biosoft目录下;你下载最新的biolinux ova包重新导入就好:https://www.omicsclass.com/article/496    linux基础不好可以观看视频课程: 《linux系统使用》

回答于 2018-12-03 15:40

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如何分析某个基因家族内的(假设只有15个基因)tandem duplicati...

可以了解一下什么是tandem duplication和segmental duplication :    https://www.omicsclass.com/question/1

回答于 2018-12-03 12:45