omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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重测序寻找T-DNA插入问题已采纳

外源插入可以参考这个查找：https://www.omicsclass.com/article/52 重测序数据比对一般用bwa；

回答于 2019-01-29 21:56

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没有基因组信息无法提取基因上游序列，我看你命令行输入的不是基因组序列吧；

回答于 2019-01-28 14:44

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qPCR相对表达量计算方法详情可参考：https://www.omicsclass.com/article/446

回答于 2019-01-27 11:31

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python版本的mcscanX会自动读取染色体ID中的数字部分用于绘图，所以会出现只有数字。绘图之后你可以用adobe illustrator打开PDF文件手动修改一下。

回答于 2019-01-27 11:28

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fasta文件格式了解一下，> 后面第一个空白前面为序列的ID，后面的所有信息都是注释信息，这些注释信息与分析无关。只要有ID就行；。

回答于 2019-01-27 11:26

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仔细检查数据，是否有错误，某个基因是否太长或者有注释错误等等；

回答于 2019-01-24 22:15

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参考一下这个这里：https://www.omicsclass.com/article/572

回答于 2019-01-24 22:12

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脚本怎么写需要学习perl语言才行：《perl语言入门到精通》《perl语言高级》

回答于 2019-01-23 09:03

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这个得再详细看看文章作者是如何分析的，有可能作者将比对结果中差异大的gap给删除了；

回答于 2019-01-23 09:00

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这里有详细的官方安装说明文档，你可以参考一下：https://github.com/tanghaibao/jcvi 如果安装不成功下载我们的biolinux：https://www.omicsclass.com/article/526

回答于 2019-01-23 08:57