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4076 个回答

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请问老师,精细定位出来的一个区间如何进行基因注释啊,

找到对应区间里面的基因,然后blast同源比对nr或者nt库注释看看基因功能。

回答于 2019-07-29 12:42

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基因家族分析

建议读读其他物种中分析这个家族的参考文献,看看别人怎么命名你这个家族;

回答于 2019-07-29 10:25

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Java环境变量配置的问题

引号去掉试试: 详细java环境配置:https://www.omicsclass.com/article/298

回答于 2019-07-29 10:15

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用网站确认结构域的时候,SMART网站没有,但CDD和PFAM都有,要舍...

你具体看看结构域序列是否是你要的结构域,是的话建议保留;

回答于 2019-07-29 10:12

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我下载了Mac版的clustalW的软件可是在第一步输入序列上出现问题...

要先输入序列才行,退到主界面选1,输入序列文件路径;

回答于 2019-07-29 10:11

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megacc运行很慢

进化树太慢,建议用NJ方法构建会快一些,ML法最慢;

回答于 2019-07-29 10:08

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我的转录本数据和gene ID不一致,所以我用的转录本ID来做的circl...

文件里面的基因ID位置对应的染色体 要一致,你的命令没有截全,有文件路径写错了,你检查一下;

回答于 2019-07-29 10:07

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用TBtools组合进化树、motif时出现了下面的情况,请老师指导

看不到你的文件,只能推测你进化树文件,gff文件,还有motiff文件里面的基因ID的统一。 还有格式要正确才行;  先试试单独或者两两组合绘制能否成功,追一排除文件格式错误

回答于 2019-07-27 15:59

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mapchart出现基因染色体错位

应该是mapchart不支持这么长的染色体,你可以把染色体长度,基因位置等信息等比例缩小试一下; 建议缩小1000000 这样单位正好是M。 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图...

回答于 2019-07-26 17:24

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测序的数据txt格式如何转换成fasta格式

可以自己编写脚本,比如用bioperl或者biopython完成fastq文件转换成fasta文件; perl示例代码:https://www.omicsclass.com/article/179

回答于 2019-07-26 09:12