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抱歉打扰,我在做circos时遇到了下面问题,看到了您也遇到相似问...

检查一下文件路径都对不,再看看文件内容 各种id是否一致,还有注意editplus设置UTF-8再编辑文件,避免linux和windows文件格式不兼容;https://www.omicsclass.com/article/395

回答于 2019-08-02 09:55

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用circos进行基因组共线性分析。config1.txt 用的是老师给的参考...

检查一下文件路径都对不,再看看文件内容 各种id是否一致,还有注意editplus设置UTF-8再编辑文件,避免linux和windows文件格式不兼容;https://www.omicsclass.com/article/395

回答于 2019-08-02 09:53

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代码使用不清楚

上面的代码,筛选出来了特定组织的样品barcode信息,存储在sample_download变量中,你需要重新获得query变量,添加barcode选项如下,然后才是是筛选后的结果,然后继续下载才是: query <- GDCquery(project = project,                  data.category = data_category,                  data.type = data_ty...

回答于 2019-07-31 11:51

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在鉴定长链非编码RNA分析中,合并转录本之后,如何批量从gffcmp....

自己编写程序批量提取,例如perl,python语言编写; 推荐学习: perl入门到精通、perl语言高级

回答于 2019-07-31 10:32

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R语言中Venn图绘制,安装vennerable包时出现以下问题,寻求老师...

试试用这个代码安装: install.packages("Vennerable", repos="http://R-Forge.R-project.org") 安装过程如下,这里有几个依赖包,dependencies ‘graph’, ‘RBGL’, ‘reshape’ are not available  报错,单独安装一下。再安装这个Vennerable包就好了 Type 'q()' to quit R.> local({r <- getOption("repos") + r["...

回答于 2019-07-31 10:16

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老师,我按照您的方式把序列路径也填上了,可还是没读进去,帮忙...

试试路径里面不要有中文,可能clustalw对中文支持不好。

回答于 2019-07-30 08:55

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请老师帮忙看看为啥一样的操作,将anchors.simple更新了基因家族...

layout文件最后不要有多余的空行,看看这个:https://www.omicsclass.com/article/571

回答于 2019-07-30 08:54

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通过转录组筛选出的基因如何设计定量pcr的引物,谢谢!

找到基因对应的cds序列用DNAman等软件设计引物就好了;

回答于 2019-07-29 17:12

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eclipse当中R插件StatET安装遇到的问题

初学者不建议用eclipse中的statET插件编写R脚本语言,建议使用Rstudio编写测试R代码会更好。

回答于 2019-07-29 13:52

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构建进化树

有些序列差异太大,建议删除些gap再构建进化树,或者直接用基因的结构域序列构建进化树;

回答于 2019-07-29 13:50