请问老师，全基因组跑出来的共线性和基因家族跑出来的共线性结果不同，也就是基因家族共线性结果有些在全基因组共线性中找不到，这种情况应该怎么处理？
不知道你的基因家族共线性怎么跑出来的？ 全基因组共线性又是用什么方法得到的？
如果两种不同的方法出现差异，可能某些参数设置有差异导致，属正常现象，以一种方法为准就行；
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