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MCScanX 使用中需要的简易gff脚本
可以自行编写perl或者python脚本从GFF文件里面提取mcscanX需要的gff文件。学习perl语言：perl入门到精通、perl语言高级 我们基因家族课程也有提供这样的脚本：基因家族分析实操课程、
回答于 2019-08-14 09:14
老师您好，请问一下这种图是怎么画出来的呢
R语言里面的pheatmap就可以绘制，可以设置一下这个参数就可以：display_numbers R语言可以学习：R语言画图、R语言快速入门与提高
回答于 2019-08-13 22:49
MCScanX基因组之间共线性：ZeroDivisionError: float division b...
检查各个文件中染色体的ID是否一致；https://www.omicsclass.com/question/1361 可以看看这个：https://www.omicsclass.com/question/1605 还有这个：https://www.omicsclass.com/article/572
回答于 2019-08-13 22:36
老师，您好！在进行不同物种之间的共线性分析时，当执行#绘制共...
看看这个：https://www.omicsclass.com/article/572 染色体ID中的数字要唯一，建议你将染色体重新用数字编号绘图，然后用Adobe illustrator 修改pdf图片； 还有检查所有文件中染色体的ID是否保持一致；
回答于 2019-08-13 22:35
老师，您好！在进行python版mcscan 共线性分析时，当执行#绘制共...
文件内容少，照着示例文件editplus手动生成就可以； 看你的截图报错是没有找到文件，你看看文件名字是不是写错了；
回答于 2019-08-13 16:37
在Bio-Linux中安装软件
这个RNA实操的课程软件安装在 /home/manager/bioapp 目录中，这些软件没有添加到环境变量中你可以自行添加。不添加的话可以用绝对路径运行； linux安装软件建议学习，软件安装和环境变量部分：linux系统使用
回答于 2019-08-13 09:09
怎么使用命令进行对各序列文件的clustalw比对？
以下是批量比对示例命令，\n代表回车，你可以批量产生这些命令写到一个sh文件里面，然后批量运行： echo "1\nWRKY_domain.fa\n2\n1\nWRKY_domain.aln\nWRKY_domain.dnd\nX\n\n\nX\n" |clustalw
回答于 2019-08-11 11:11