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老师,可不可以把整个基因家族全部基因的算KA ks,计算选择压力

只有相似的基因才可以计算kaks,差异大的基因之间计算不了; 所以只能就是相互复制的基因; 全部都去计算没意义

回答于 2020-04-30 17:46

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对基因家族里面所有的成员进行kaks计算,而不仅对串联重复基因进...

只有相似的基因才可以计算kaks,差异大的基因之间计算不了; 所以只能就是相互复制的基因; 全部都去计算没意义

回答于 2020-04-30 17:46

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请问各位老师 我通过trinity拼接出来的序列,然后rsem定量,结果...

是不是 比对或者定量的时候,普通文库与链特异性文库搞错了;

回答于 2020-04-30 17:44

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请问关于转录本拼接整合的问题

MSTRG 开头的基因是新组装的基因,如果不关系新基因,这些可以忽略

回答于 2020-04-30 17:43

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请问老师,pheatmap是否有修改热图中文本字体样式的功能呢?谢谢...

字体修改,简单的办法,可以输出pdf图片,用Adobe illustrater 修改字体; 如果要用代码设置字体,课程里面有讲。建议你学习一下: R语言快速入门与提高、

回答于 2020-04-30 17:41

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老师,请问差异mRNA怎样用R语言与得到的靶向mRNA对比呢?

没明白你的意思,是要得到RNA的靶基因吗,可以做chip-seq免疫共沉淀分析,得到靶基因

回答于 2020-04-30 17:39

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比较基因组共线性作图疑问

更多的绘图设置可参考官方文档: https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version) 或者也可看看这个:https://www.omicsclass.com/article/506

回答于 2020-04-30 17:38

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这个虚拟化问题怎么解决?求指导啊

虚拟机安装参考:https://www.omicsclass.com/article/526 BIOS里面的虚拟化开启一下:https://www.omicsclass.com/article/78

回答于 2020-04-30 17:36

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求助:建库的时候显示 fa 文件不存在

输入命令的时候,看看是不是在中文状态下输入了;

回答于 2020-04-30 17:34

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怎么利用公开的转录组做基因家族的表达分析,还有GEO和SRA的区别...

GEO一般收录基因芯片的表达数据,但是也有高通量的测序数据上传到了GEO,具体的数据你需要查看说明; SRA为NCBI提供的专门收留高通量原始测序数据的一个数据库,好多杂志要求发文是公开数据那么作者一般会上传NCBI的SRA数据库; 一般做基因家族分析,最后可以利用转录组数据,看看基因家族成员的基因表达模式等等; 如...

回答于 2020-04-28 10:55