omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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GSDS error 报错

报错已经显示了：

回答于 2020-04-17 11:39

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文件格式可能有问题吧，meme运行的时间有些久，你确定正确运行完成吗？

回答于 2020-04-17 11:38

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看看其他的没有出来的ID对应的数据格式是否有异常。

回答于 2020-04-17 11:37

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课前说明，下载完基因组，应该检查一下各个文件中ID之间的对应关系，你可以再看看课程；我看你的ID是不是处理过；怎么有那么多.1.1.1

回答于 2020-04-17 11:33

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下载的版本比对吧，应该下载这个社区版本的；https://www.eclipse.org/downloads/packages/

回答于 2020-04-17 11:24

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没理解你的圈内啥意思，不好回答

回答于 2020-04-16 17:30

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你这两种数据无法放在一起分析差异甲基化。

回答于 2020-04-16 17:29

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可以写一个perl脚本完成：课程里面有的：学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读

回答于 2020-04-16 17:27

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可以使用hmmersearch 批量鉴定哪些基因为bHLH 转录因子；至于这这个基因的特点你需要阅读相关文献了解一下；想分析基因家族可以学习课程：学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读

回答于 2020-04-16 17:26

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一个是CDS，一个文件是翻译后得蛋白序列文件吧，你下载下来用notepad++打开看看；里面得README多看看

回答于 2020-04-15 13:12