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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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blast比对之后

得到蛋白序列,后续可以做进化树,基因结构,meme motif等分析:https://www.omicsclass.com/article/525

回答于 2020-04-27 10:47

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做基因组间共线性时用下面这个命令进行过滤,我想问一下这个命令...

具体方法可以参考这里:https://www.omicsclass.com/article/493

回答于 2020-04-27 10:46

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老师你好!有关MCscan的使用

mcscanX也可以做比较基因组分析见:https://www.omicsclass.com/article/275 或者用python版本的mcscan:https://www.omicsclass.com/article/284 我们基因家族课程里面都有讲解:

回答于 2020-04-24 13:21

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Graphpad Prism 能制作气泡图吗?怎么操作那?

这个没有用过,不知道可不可以;

回答于 2020-04-24 13:18

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请问这两个基因ID不同是有什么区别吗?在后面做筛选的时候,就只...

这个区别你可以看看这些ID对应的数据是否有差别,可在GFF文件里面看看,

回答于 2020-04-24 13:17

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GDCdownload(query = query, directory = DataDirec...

改成 method='api'  换种方式下载数据

回答于 2020-04-24 13:17

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在R中进行差异表达分析,运行GDCdownload(query = query,...

method='api'  改成这个试试;

回答于 2020-04-24 13:16

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老师您好,在GEPIA中,可以进行TCGA和GTEX的对比分析,因为我研...

表达值可以使用 基因的counts值,批次效应可以参考:https://www.omicsclass.com/article/1113 不过都是真对GEO数据的,高通量测序数据不知道是否可行;

回答于 2020-04-24 13:15

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sratoolkit中prefetch下载一直报错是不是因为网的事情?

换个网络,或者试试其他方法吧:https://www.omicsclass.com/article/964

回答于 2020-04-24 13:13

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想问一下老师这个是怎么回事?

安装的 是docker desktop吗?   可能是网络原因,建议设置一下国内的镜像:https://www.omicsclass.com/article/1198

回答于 2020-04-24 13:11