如何将TCGA中下载的CNV数据:GDC_Aliquot转为Hugo_Symbol, Segment_Mean转变为拷贝数变异的5个离散值(0:无变化 1:拷贝数增加 2:高水平扩增 -2:纯合性缺失 -1:半合子缺失)。如下图所示

attachments-2020-05-chjTt7f45eba5f7552a32.png

将上图转变为

attachments-2020-05-T32o2cNS5eba607177d44.png


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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

用python 或者perl写个脚本转换以下就好了;

perl入门到精通perl语言高级R语言画图R语言快速入门与提高python语言入门到精通

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  • momo 提出于 2020-05-12 16:39

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