omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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在QTL-seq分析的时候的vcf文件中双亲在后面，而子代双池在前面，...

如果用的是组学大讲堂提供的docker镜像就不需要更改，只是命令行参数样本名字写对就可以，因为我们对qtlseq这个python脚本做过修改；但是，你自己安装的软件就按照软件说明使用。

回答于 2021-02-22 10:40

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后面的motif只在两个基因中出现，你可以把motif的长度范围设置大一些看看能不能再找到更多的motif

回答于 2021-02-19 16:03

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你检查你的基因ID是不是entrzID，不是的话需要转换一下

回答于 2021-02-18 15:44

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不知道你怎么搜索的，一半也不一定错误吧

回答于 2021-02-16 16:05

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上一步生成gvcf有问题吧，

回答于 2021-02-16 16:04

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重启试试，再不行重新安装

回答于 2021-02-16 16:03

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输入文件路径或者文件名字写错了，你仔细检查命令行

回答于 2021-02-16 16:03

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有课程你可以学习一下：https://bdtcd.xetslk.com/s/qZRiF

回答于 2021-02-16 16:02

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你应该先下载相应的镜像：docker pull 扩增子分析相关课程见： https://bdtcd.xetslk.com/s/qZRiF

回答于 2021-02-16 16:01

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你的镜像应该提前下载好；这个课程里面有详细的使用教程：https://bdtcd.xetslk.com/s/qZRiF

回答于 2021-02-16 16:00