突变速率不同的物种是不一样的,一般是通过查阅相关文献获得:https://www.omicsclass.com/question/896
回答于 2021-02-22 11:49
你的系统有些软件没有安装, 建议学习我们的重测序课程,里面有变异检测分析课程:https://bdtcd.xetslk.com/s/1VQOjQ
回答于 2021-02-22 11:47
建议你看看 group这个变量和exp的列名是否有交集,自己检查数据; R语言基础:https://bdtcd.xetslk.com/s/2G8tHr
回答于 2021-02-22 10:57
原版这里有:https://github.com/YuSugihara/QTL-seq 但是组学大讲堂提供的做过修改:https://github.com/omicsclass/QTL-seq
回答于 2021-02-22 10:55
你都没说你分析得是哪个家族,我也不知道你的家族亚组怎么分?建议你在读读文献多多了解自己的家族自然就会分析了; 不同数据库确认结构域,建议取并集,有些数据库更新比较慢结果有差异是正常的;
回答于 2021-02-22 10:47
如果用的是组学大讲堂提供的docker镜像就不需要更改,只是命令行参数样本名字写对就可以,因为我们对qtlseq这个python脚本做过修改; 但是,你自己安装的软件就按照软件说明使用。
回答于 2021-02-22 10:40
后面的motif只在两个基因中出现,你可以把motif的长度范围设置大一些看看能不能再找到更多的motif
回答于 2021-02-19 16:03