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基因家族成员筛选

这些结果也可以保留,也可以删除,文章方法部分说明就好;例如这篇NBS基因家族文章就保留了: Lozano et al. BMC Genomics (2015) 16:360 DOI 10.1186/s12864-015-1554-9

回答于 2021-02-24 16:02

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什么是链特异性文库?

刚接触高通量测序的时候就知道有链特异性建库这么个概念,当时也了解可以利用加U法,但是没有思考其中的细节。最近把这个概念掰开了揉碎了好好理解,终于填上了这个坑。 正式讲之前,有几个概念是要明确的。 DNA 的正链和负链,就是那两条反向互补的链。参考基因组给出的那个链就是所谓的正链(forword),另一条链是反链...

回答于 2021-02-24 15:51

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安装qtlseq后,运行程序出现ModuleNotFoundError: No module nam...

python 的numpy包安装一下吧; 基础不好按照我们的课程来吧,你这样很费劲的;  生物信息入门到精通必修基础课:linux系统使用、docker搭建生物信息分析环境、实验室linux生信分析平台搭建、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到精通

回答于 2021-02-22 18:00

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老师,从原版上或者你的改进版上下载或者安装qtlseq的时候,用co...

conda安装的是  原始版本;不是我们的版本,我们的版本需要下载手动安装; 

回答于 2021-02-22 17:28

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请问怎么确定突变速率r呢?

突变速率不同的物种是不一样的,一般是通过查阅相关文献获得:https://www.omicsclass.com/question/896

回答于 2021-02-22 11:49

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黄老师,用的你在github上的qtlseq,运用原始数据,从cleanreads...

你的系统有些软件没有安装, 建议学习我们的重测序课程,里面有变异检测分析课程:https://bdtcd.xetslk.com/s/1VQOjQ

回答于 2021-02-22 11:47

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老师您好,我在进行GEO数据差异分析时,出现如下报错,请问我该...

建议你看看 group这个变量和exp的列名是否有交集,自己检查数据; R语言基础:https://bdtcd.xetslk.com/s/2G8tHr

回答于 2021-02-22 10:57

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QTL-seq数据分析实操课程中命令中用到的qtlplot,如果不使用dock...

原版这里有:https://github.com/YuSugihara/QTL-seq 但是组学大讲堂提供的做过修改:https://github.com/omicsclass/QTL-seq

回答于 2021-02-22 10:55

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基因家族鉴定

你都没说你分析得是哪个家族,我也不知道你的家族亚组怎么分?建议你在读读文献多多了解自己的家族自然就会分析了;  不同数据库确认结构域,建议取并集,有些数据库更新比较慢结果有差异是正常的;

回答于 2021-02-22 10:47

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老师您好,请问,我本来有11个样本,按课程里面的代码输入后,为...

我数了是11列样本: 你的数据里面没有 ID和gene symbol 这个出错了吧

回答于 2021-02-22 10:45