10 安捷伦Agilent双通道文件,如何做差异分析?是否直接用红荧光的数据就可以跟单通道文件一样处理吗

已经分清单通道和双通道数据的区别。且根据定义,红荧光代表处理组,绿荧光代表对照组,且M值=log2(R/G),能够看出该基因在该样本的上下调情况,即负值代表下调,正值代表上调。而似乎做差异表达分析的数据不该出现负值。因此,通过对raw文件的处理,得到了红绿荧光的表达量,那么是否可以直接用红荧光的数据来做差异表达及其他分析呢?还是用M值做呢

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

双通道 芯片 不用做差异分析,直接就给出差异表达的基因了;https://www.omicsclass.com/question/1441

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  • lkjhg_mm 提出于 2021-03-14 15:15

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