omicsgene
omicsgene - 生物信息
实名认证 专业认证

性别: 北京 - 北京市 注册于 2018-04-20

擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

生物信息

向TA求助
14321金币数
80990 经验值
445个粉丝
主页被访问 86563 次

4092 个回答

0 赞同

老师,镜像版本合适,数据我是从Demo转的,但是还是不行,我用re...

你的操作和输入文件都和课程里面的一样?  也报这个错误吗? 如果是这样,你可以换个电脑试试;  或者你换RDP ; 或者学习后面的qiime2分析;

回答于 2021-06-04 12:16

1 赞同

小白自学生信,应该怎么开始啊?有没有大佬,菩萨给些资源资料啊

先学习基础课; 6. 生物信息入门到精通必修基础课:linux系统使用、docker搭建生物信息分析环境、实验室linux生信分析平台搭建、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到精通

回答于 2021-06-04 12:08

0 赞同

老师您好 ,我想问下提不出结构域序列跟蛋白序列是什么原因 ,基...

j检查hmm out文件  第一列的ID 出现在 Brapa.protein.fa 文件里面; 可能是ID不一致 脚本找不到对应的序列;

回答于 2021-06-02 10:09

0 赞同

就想提取基因的结构域序列跟蛋白序列。可是按笔记里面的脚本提出...

用哪个笔记?那个脚本提取的?  运行的命令呢?

回答于 2021-06-02 10:08

0 赞同

老师,我用的就是课程里的代码,分配了6个g,还是报错了,麻烦老...

镜像版本是: v1.2版本吗?   保持版本一致; 再检查一下你的输入文件,qiime.fasta 文件格式是不是qiime要求的格式,或者截图出来我看看; 或者是内存不够,找个内存高的电脑重新分析。

回答于 2021-06-02 10:01

0 赞同

关于细菌illumina测序数据demultiplex的问题

哪里测的数据,建议找公司拆分数据吧;  

回答于 2021-06-01 09:23

0 赞同

关于q2-cutadapt demux 的问题

你说的是这个帖子吗?https://www.omicsclass.com/article/1397  参数指定的是meta文件里面的列名;不是文件;

回答于 2021-05-31 09:45

0 赞同

请问在NCBI上使用CD-search检测蛋白的保守结构域,怎么看它是不...

根据 start 和end 信息知道结构域的长度; 再和你家族的domain真实长度对比一下; 短了就是不完整;

回答于 2021-05-29 20:46

0 赞同

老师 您好,请问转录组测序所得到的转录本序列是所测品种的转录...

是你 测的那个取的样本的转录本

回答于 2021-05-29 20:44

0 赞同

请问老师基因家族表达量通过NCBI SRA数据库下载转录组需要下载三...

三个 都下载,不用平均 ,直接 绘制热图就可以

回答于 2021-05-29 20:43