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老师您好,今天利用docker进行基因家族分析进入组学大讲堂虚拟机...

小鲸鱼打开了吗?  后台小鲸鱼要先打开才行:

回答于 2021-05-21 09:19

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CIBERSORT与ssGSEA算出来的结果相反

检查下数据分析过程中是不是有错误, 可能是分析错了;  也有可能是两个软件的算法差异导致的

回答于 2021-05-20 16:50

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黄老师,能不能在虚拟机上安装一个linux版本的paircoil2,我们用...

用在线网站吧:http://cb.csail.mit.edu/cb/paircoil2/paircoil2.html

回答于 2021-05-20 09:49

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请教一下大家 用mega做进化树是要把序列两端给剪切对齐吗 序列之...

需要手动截切一下,保留保守的序列构建进化树; 不合法的氨基酸,你检查一下这一行;

回答于 2021-05-18 17:50

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老师您好,请求帮助!MENA分子生态网络分析时,上传200个OTU节点...

没看到结果,可能是有些节点 没有和其他节点有连线,所以没有显示吧;

回答于 2021-05-18 10:25

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SSR查找及引物设计

用的perl版本太高了; 用biolinux里面的perl试试吧;

回答于 2021-05-18 10:24

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请问一下,FPKM的数据不需要作背景处理、四分位数校正了吗?

FPKM  是RNAseq 测序的数据,与基因芯片的数据不一样;FPKM本身就是标准化之后的数据,不需要做背景;

回答于 2021-05-14 18:23

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devtools安装出错

yum install  libgit2-devel  ./R CMD INSTALL gert_1.3.0.tar.gz

回答于 2021-05-14 12:03

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R包安装错误 cp: cannot stat ‘hdf5/src/.libs/libhdf5.a’: No...

解决版本参考:https://github.com/grimbough/Rhdf5lib/issues/34 BiocManager::install('grimbough/Rhdf5lib', ref="cpp-flags", configure.args = "--disable-ros3-vfd")

回答于 2021-05-14 11:20

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GPL7280的数据,可以读取进来,处理的过程中总是报错,请问这个c...

代码运行的有问题吧,没有指定文件; files = list.files(setwd(paste0(workdir,"/",GSE,"_RAW")), pattern = "GSM") files AffyBatch=ReadAffy(filenames=files)

回答于 2021-05-09 10:10