10 老师好,如何去除指定区间的序列啊

我百度了很多可以提取指定区间序列的方法 比如samtools就很简单:samtools faidx input.fa chr1:100-200 > chr1.fa

但是我没有找到反选的,就是除了指定区间我都不要

请先 登录 后评论

1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

那你自己反选一下就好了;  

samtools faidx input.fa chr1:200-100000000 > chr1.fa
samtools faidx input.fa chr1:0-100 > chr11.fa
请先 登录 后评论
  • 1 关注
  • 0 收藏,116 浏览
  • 匡卓然 提出于 2021-06-17 16:58