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pfam

hmm模型下载方法见这里:https://www.omicsclass.com/article/76

回答于 2021-06-18 22:00

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请问怎么找到染色体对应的物理距离,以及这段物理距离包含的SNP...

SNP文件有染色体和位置信息,直接在SNP文件里面找物理位置就好;  SNP文件一般存储VCF文件;第一列染色体,第二列物理位置:https://www.omicsclass.com/article/6 

回答于 2021-06-18 21:57

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老师,Java 的安装包可以发一下吗?

https://www.oracle.com/java/technologies/javase-jdk16-downloads.html

回答于 2021-06-18 21:56

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Java的安装包,可以发一下吗?

这里有:https://www.oracle.com/java/technologies/javase/javase-jdk8-downloads.html 最新:https://www.oracle.com/java/technologies/javase-jdk16-downloads.html

回答于 2021-06-18 21:55

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老师,我在进行基因家族成员鉴定的时候,发现我的结果和已发表的...

不同的物种家族成员有差别是正常的;我不知道你怎么搜索的,可能搜索有错误导致数量太少;

回答于 2021-06-15 09:41

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请问不同疾病,不同的GSE号可以联合起来做WGCNA分析吗?可以的话...

最好 不要,这样会有批次效应,如果联合应该去除一下批次效应,R中sva包可以去除:https://www.omicsclass.com/article/1113

回答于 2021-06-15 09:40

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windows中git bash中运行R代码无权限安装

 在git bash快捷方式上“右键”-->"属性"-->“兼容性”-->勾选“以管理员身份xxx”-->“确定”。   永久以管理元身份运行即可;

回答于 2021-06-07 14:42

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一个基因家族得到两个结构域的ID,然后把两个ID合并去除相同的ID...

可以用hmmer分别用这两个隐马尔可夫文件搜索两次得到的结果文件取交集就可以了; 

回答于 2021-06-07 09:41

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请问一下基因结构图不显示UTR是啥原因?这个图做成这样正常吗?

基因组GFF如果没有注释UTR信息,就不会显示,你可以查看一下GFF文件;

回答于 2021-06-07 09:39

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WGCNA可以将来自不同组织的表达量数据放在一起计算吗

可以的,但是样本量还是有些少,结果可能不太好;

回答于 2021-06-07 09:38