omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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各位大佬好！我在筛选一批转录组数据里的差异基因时，当进行到构...

是的， DESeq2要求输入的是readcount 值为整数，你这数据不是整数不能输入；

回答于 2021-07-20 10:25

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没用过tbtools做共线性，不清楚哪里出错了；我们使用mcscan做共线性，详细见课程：https://bdtcd.xetslk.com/s/1BAqPp

回答于 2021-07-20 10:24

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我们现在不支出biolinux了，用更好的工具docker ：https://www.omicsclass.com/article/1198

回答于 2021-07-19 10:28

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不用过滤这些都是myb基因

回答于 2021-07-19 09:32

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样本太少了，如果是转录组测序的数据可以试试 ebseq这个R包

回答于 2021-07-18 09:11

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系统版本没有设置正确：还有存储和内存不是一个东西： docker 默认是安装到C盘的，可能你的C盘空间不足吧；做生信分析还是弄个好些的电脑，避免不必要的麻烦错误看看这个安装：https://www.omicsclass.com/article/1243

回答于 2021-07-16 09:20

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内存不够，系统自动杀死了；课程里面说过了，选个性能好的电脑，内存 32G以上吧越多越好

回答于 2021-07-15 12:59

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按照课程里面的命令来运行即可，：https://bdtcd.xetslk.com/s/1VQOjQ HaplotypeCaller报错了是不是你电脑的内存不够，这步样本越多越挺耗内存的准备100G以上的内存吧

回答于 2021-07-15 10:47

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新课程已经更新了： https://bdtcd.xetslk.com/s/1BAqPp 或者使用这里的配置文件：https://www.omicsclass.com/article/644

回答于 2021-07-14 11:26

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这个不是我们的课程

回答于 2021-07-13 18:22