omicsgene
omicsgene - 生物信息
实名认证 专业认证

性别: 北京 - 北京市 注册于 2018-04-20

擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

生物信息

向TA求助
14484金币数
81890 经验值
447个粉丝
主页被访问 89342 次

4108 个回答

0 赞同

R进行cox生存分析时读入临床数据一直报错

你的输入文件 编码格式 统一成UTF-8 的文本文件,可能里面有中文字符,或者特殊字符导致输入失败。 R语言基础入门见: https://bdtcd.xetslk.com/s/2G8tHr 

回答于 2021-08-02 09:25

0 赞同

老师,您好,我在用你TCGA课程的cox函数做生存分析,每次通过bar...

读取数据的时候,read.table  里面的check.names=FALSE , 关闭R的自动列名检查。

回答于 2021-08-02 09:22

0 赞同

请问老师有没有"医学癌症TCGA-基因差异表达分析"课程基因表达数...

可以根据临床信息  筛选癌症组织的样本; 课程在更新中,这里涉及一些数据下载: https://study.163.com/course/courseMain.htm?courseId=1211743803&share=2&shareId=400000000234009 

回答于 2021-08-02 09:19

0 赞同

老师,这是我在做共线性分析最后一步出来的结果,但我看不懂,麻...

输入文件的路径 都检查一下看看,可能是i文件路径写错了; 然后再检查文件内容是否有问题;

回答于 2021-08-02 09:17

0 赞同

请问一下使用NCBI中GCF文件和GCA文件进行家族分析时,基因数目的...

不建议到NCBI上下载基因组,格式不标准 这里的还乱; 到其他网站下载基因组,比如ensembl  JGI  https://www.omicsclass.com/article/58   等等

回答于 2021-07-30 16:45

0 赞同

在基因组组装中,有很多scaffold没有组装到基因组上,是因为什么...

技术 限制,  资金限制,基因组太复杂 等等原因,组装的基因组不完整;

回答于 2021-07-30 16:44

0 赞同

MEGA构树NJ法出现的问题

boot的时候有的无法构建进化树;失败了;

回答于 2021-07-29 11:51

0 赞同

BSA数据在哪里下载呢?

你说的是课程吗? :https://study.163.com/course/courseMain.htm?courseId=1211590812&share=2&shareId=1030291076 看课程的第一节

回答于 2021-07-28 17:46

0 赞同

老师你好,在家族分析中,用tiquxulie.pl脚本提取序列时,总是报...

检查下你基因组里面的染色体编号和你的提供的这个文件的染色体编号是否一致; 我们的课程已经更新了,脚本也更新了,可以看新课程:https://bdtcd.xetslk.com/s/1BAqPp 

回答于 2021-07-28 16:36

1 赞同

mcscanx

看看这个Id 是不是一致的: 还有你的命令行可能有错误;输入文件没输进去

回答于 2021-07-27 11:36