omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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MEGA构树NJ法出现的问题

boot的时候有的无法构建进化树；失败了；

回答于 2021-07-29 11:51

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你说的是课程吗？：https://study.163.com/course/courseMain.htm?courseId=1211590812&share=2&shareId=1030291076 看课程的第一节

回答于 2021-07-28 17:46

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检查下你基因组里面的染色体编号和你的提供的这个文件的染色体编号是否一致；我们的课程已经更新了，脚本也更新了，可以看新课程:https://bdtcd.xetslk.com/s/1BAqPp

回答于 2021-07-28 16:36

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看看这个Id 是不是一致的：还有你的命令行可能有错误；输入文件没输进去

回答于 2021-07-27 11:36

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这个图用R包pheatmap做的：背后的数据为微生物扩增子数据，扩增子数据分析课程见：https://bdtcd.xetslk.com/s/qZRiF

回答于 2021-07-26 15:20

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可能前面的分析有报错，导致后面的分析没有结果；

回答于 2021-07-26 09:31

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转录组分析镜像更新到v1.1 试试： docker pull omicsclass/rnaseq:v1.1

回答于 2021-07-26 09:30

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你说的是课程吗？：https://study.163.com/course/courseMain.htm?courseId=1211590812&share=2&shareId=1030291076 看课程的第一节

回答于 2021-07-26 09:24

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基因的cds序列可以根据基因组的GFF注释信息或者位置信息，到基因组中截取；我们可以提供提取服务，找群主：787097236

回答于 2021-07-26 09:22

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NCBI上面的基因组整理的GFF不标准，可以到别的网站下载基因组文件；或者自己写脚本提取；或者找群主付费修改GFF文件787097236

回答于 2021-07-26 09:20