omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

0 赞同

按照课程里的代码用R分析TCGA数据差异基因的KEGG富集，发生报错

网速不好吧，等会重新运行这行代码再试试；

回答于 2021-08-04 13:25

0 赞同

重新运行这个脚本试试；不行的话用后面课程的 docker吧；

回答于 2021-08-03 09:25

0 赞同

简单的话，拿到靶基因的序列到NCBI里面blast搜索一下，看看他的同源比对的基因功能，大概就知道他的功能了；

回答于 2021-08-02 09:32

0 赞同

苹果是否可以安装primer3 需要查看 primer3 是否有mac版本的；没有的话安装不了； misa生存的结果文件需要自己写代码完成批量引物设计这里有课程：https://bdtcd.xetslk.com/s/JKkbr 我们也提供SSR引物设计，加QQ找群主：787097236

回答于 2021-08-02 09:29

0 赞同

你的输入文件编码格式统一成UTF-8 的文本文件，可能里面有中文字符，或者特殊字符导致输入失败。 R语言基础入门见: https://bdtcd.xetslk.com/s/2G8tHr

回答于 2021-08-02 09:25

0 赞同

读取数据的时候，read.table 里面的check.names=FALSE , 关闭R的自动列名检查。

回答于 2021-08-02 09:22

0 赞同

可以根据临床信息筛选癌症组织的样本；课程在更新中，这里涉及一些数据下载： https://study.163.com/course/courseMain.htm?courseId=1211743803&share=2&shareId=400000000234009

回答于 2021-08-02 09:19

0 赞同

输入文件的路径都检查一下看看，可能是i文件路径写错了；然后再检查文件内容是否有问题；

回答于 2021-08-02 09:17

0 赞同

不建议到NCBI上下载基因组，格式不标准这里的还乱；到其他网站下载基因组，比如ensembl JGI https://www.omicsclass.com/article/58 等等

回答于 2021-07-30 16:45

0 赞同

技术限制，资金限制，基因组太复杂等等原因，组装的基因组不完整；

回答于 2021-07-30 16:44