omicsgene
omicsgene - 生物信息
实名认证 专业认证

性别: 北京 - 北京市 注册于 2018-04-20

擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

生物信息

向TA求助
14320金币数
80980 经验值
444个粉丝
主页被访问 86457 次

4091 个回答

0 赞同

annovar报错问题

有些参考基因组里面有一些 ambiguous 碱基 ,ANNOVAR处理不了,这是作者的回答:https://annovar.openbioinformatics.org/en/latest/misc/faq/  解决办法就是将  ambiguous 碱基根据IUPAC :(https://www.omicsclass.com/article/409 )编码替换成一单个碱基;

回答于 2022-05-08 16:10

0 赞同

设置镜像加速器时出现无法识别代码

镜像加速 这个可以不用设置:

回答于 2022-05-08 16:09

0 赞同

MEME分析中,motif的E-value值太高,意味着不准确了。对吧。

j结构域 domain 就是motif,  按理来说 这些家族成员都有相同的domain,都会找到motif; 你把 以下参数调整一下  可以把motif 最大长度调成200 试试,有可能找到更多motif -nmotifs 10 -minw 6 -maxw 200

回答于 2022-05-06 11:37

0 赞同

bioenv环境因子筛选运行10几个小时了 还没出结果 env16个 otu300...

电脑性能差,运行的时间会比较久; 或者电脑卡了,你重新运行试试的

回答于 2022-05-04 15:28

0 赞同

老师,在进行基因上游顺势原件分析的时候,得到的图是下面这个样...

这个涂怎么了,我看没啥问题

回答于 2022-05-04 15:27

0 赞同

按照视频课安装docker.hyper-v打开后,电脑连不上校园网,请问怎...

hyper-V  和联网没关系的,你重启电脑试试

回答于 2022-05-04 15:26

0 赞同

老师,我在进行基因上游顺势作用原件分析的时候,在得到feature...

feature.bed 文件可以自己在excel里面生成;挑选自己感兴趣的顺势作用元件

回答于 2022-05-04 15:26

0 赞同

mega11NJ法构树闪退

换 mega10 或者mega7试试

回答于 2022-05-04 15:24

0 赞同

老师您好,基因家族分析时,用拟南芥某基因家族用blast比对目标...

直接提取503条序列 提交到NCBI CDD里面查找结构域。再决定取舍

回答于 2022-04-29 15:33

0 赞同

你好,我安装gwas的镜像报错failed to register layer: ApplyLay...

电脑存储不够吧,你看看电脑硬盘存储是不是满了,或者看看docker磁盘多分配些: 刚刚测试了下latest下载,没有报错:

回答于 2022-04-29 09:38