非模式物种GO与KEGG富集分析个人数据运行时出不了结果,寻找解决办法

按照RNA-seq课程教的方面,将自己的课程数据换成自己的数据,得不到结果。中间不知道哪里错了,麻烦老师给个解决的办法,谢谢attachments-2022-07-3WKhgukX62e24ccc76d69.jpgattachments-2022-07-n0MptNJE62e24d914b275.jpgattachments-2022-07-1xSae6e562e24db0968ab.jpg

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2 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

蛋白序列里面的ID要和gff里面的mRNA ID 一样,脚本才可以根据GFF文件找到基因对应的蛋白序列;

你这个ID不一致导致程序出错attachments-2022-07-PvWMBI2V62e35a6117e39.png

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痕云飞扬

老师,您好!您的意思是得把GFF中所有与蛋白质序列ID信息不一致的都删除吗?看gff文件中的ID与蛋白质序列一致的都是region为cds的,那我就把不是cds的删除了重新做吗?谢谢老师!

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  • 痕云飞扬 提出于 2022-07-28 16:51

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