omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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老师，我在做基因结构分析的时候，有的基因上没有这10个保守结构...

差异比较大吧，你调整一下meme的参数，让他找到更多的motif，也可以把motif的长度范围调大一些试试；

回答于 2022-06-06 10:06

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设置重复，去掉一个；

回答于 2022-06-06 10:05

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不要用记事本操作文件，统一一下文件格式：https://www.omicsclass.com/article/395 文件问题，按照提示修改一下；我看还有空行，你需要调整一下；

回答于 2022-06-06 10:04

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不要用记事本操作文件，用notepad++ ；统一一下文件格式：https://www.omicsclass.com/article/395 文件问题，按照提示修改一下；我看还有空行，你需要调整一下；

回答于 2022-06-06 10:04

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不要用记事本操作文件，统一一下文件格式：https://www.omicsclass.com/article/395 文件问题，按照提示修改一下；我看还有空行，你需要调整一下；

回答于 2022-06-06 10:04

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数据量大，内存占用多正常的，只能提高内存；或者换其他软件试试，fasttree 等

回答于 2022-06-01 07:37

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细分基因家族的话，需要了解自己的家族特点进行细分，或者参考文献其他人如何分类的；

回答于 2022-05-27 18:12

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运行的命令看不到，你的命令行有错误吧；建议使用我们的docker镜像；

回答于 2022-05-27 18:09

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可以用hmmersearch 进行搜索判断结构域；具体可以学习基因家族分析课程：https://zzw.h5.xeknow.com/s/bGBQV

回答于 2022-05-26 09:26

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上图应该是 ssgsea 分析出来的结果；有分析需求可以找QQ群主： 574472687

回答于 2022-05-26 09:24