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4143 个回答

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tassel做GWAS的时候曼哈顿图画不出来

pvalue 文件第三列去掉不是数字的行;

回答于 2022-07-05 18:33

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做GWAS的时候,后面的模型都用到多年数据,只有当年数据怎么解决...

只有 blup采用多年多点的数据,你照着例子  也就是blup出来的例子文件格式准备自己的表型数据就行;  这是例子:https://bitbucket.org/tasseladmin/tassel-5-source/wiki/UserManual/Load/Load 一年的数据,第一列是样本名字,后面的不同表型的数值

回答于 2022-07-05 18:30

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关于16S去噪的问题

merge之后损失的数量最多,可能是没有测通吧,你问问他们建库长度是不是不对。

回答于 2022-07-04 09:51

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物种分类树图

检查你的输入数据,是不是有的行,没有 k__Bacteria, 如果有得话 把他删除试试

回答于 2022-06-29 14:17

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选择数据问题

建议选择紫色的数据,可以直接从拼接开始做, 再有,你的数据怎么处理的还是得咨询测序公司,我这里只是猜测;

回答于 2022-06-29 14:08

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质控数据

这个length required 是把小于这个值的序列删除; 你这个设置个280bp左右即可;保留大部分的read 还有就是你的引物扩增的区域(V3?V4 or V3+V4?) 长度做参考; 

回答于 2022-06-29 14:05

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OUT分析速度太慢

跑一天正常的,想速度快只能提高电脑配置; 数据量再多可能会跑好几天

回答于 2022-06-29 13:56

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OTU分析报错

这个 segmentation fault  报错,可能是系统问题,你换个电脑试试的;

回答于 2022-06-29 09:32

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启动子feature.bed

看不懂 shell,你看结果文件,照着 用excel做一个表格,粘贴到notepad 里面保存一下就行;

回答于 2022-06-29 09:30

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OTU分析报错

只是警告 没事的 

回答于 2022-06-29 09:29