omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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基因家族启动子分析1

看这个

回答于 2022-08-08 11:51

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基因上游的序列为promoter 序列； promoter不在基因上；

回答于 2022-08-08 11:49

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从ATG往上截取1500bp的

回答于 2022-08-07 12:03

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VCF文件和参考基因组不是配套吧，你检查一下；

回答于 2022-08-04 13:36

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可以分别搜索再合并；

回答于 2022-08-02 10:16

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STAMP软件绘制的，

回答于 2022-08-02 10:15

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看看这个：https://www.omicsclass.com/question/4816

回答于 2022-08-01 07:40

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工作路径不对，必须在当前工作路径下才行：你到car.py 路径，右键打款jupyter，这样工作路径就自动是car.py 了，具体操作： https://www.omicsclass.com/article/1425

回答于 2022-08-01 07:38

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用pheatmap绘图：https://www.omicsclass.com/article/1162 设置：scale = "row"

回答于 2022-07-29 11:58

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蛋白序列里面的ID要和gff里面的mRNA ID 一样，脚本才可以根据GFF文件找到基因对应的蛋白序列；你这个ID不一致导致程序出错

回答于 2022-07-29 11:56