基因家族第14课时,基因家族加倍与复制中分析的问题

#找到我们分析的基因家族的共线性分析关系(大片段复制现象):

cd /work/my_gene_family/MCScanX

perl /biosoft/MCScanX/MCScanX/downstream_analyses/detect_collinearity_within_gene_families.pl -i crk_family.txt -d mcscan/os.collinearity -o crk.collinear.pairs

这一步分析后,产生的.collinear.pairs文件中,没有找到对应的复制基因,是我分析的基因确实没有加倍与复制,还是输入的crk_family.txt文件格式有问题(确实是制表符分隔的)?

详情见图attachments-2022-09-BnTKW1ry63256481c5c6c.jpg

attachments-2022-09-xNqjHxfV6325648b36f24.jpg

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

如果前面的共线性分析操作都正确的话;

结果没有就是没有了;

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  • 文西 提出于 2022-09-17 14:09

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