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关于候选基因gene id的转换
这个格式是基因组注释时候批量命名的ID； 想对应基因的name，你可以把这个基因的序列到NCBI上的nr或者nt库注释一下，看看有没有别人研究过这个类似的基因对应的名字，可以借鉴过来；
回答于 2022-08-30 09:42
docker运行mcscanX出现空指针
所有输入文件路径检查一下是否正确； 还有文件内容都检查一下 是否有异常；染色体ID是否一致等； 不会检查，就把文件贴图，别人好帮你检查一下；
回答于 2022-08-29 10:01
blast建库,DNA序列,all vs all 比对后输出文件0kb
运行的时候 有什么报错吗？ 你的输入文件可能有问题吧： 提问方法：https://www.omicsclass.com/article/82
回答于 2022-08-28 18:21
用tiquxulie.pl时，出现报错: 提取的序列长度大于序列总长？？
你这个提取序列脚本是提取基因上游的promoter序列吗？ 如果是的话，有些基因位置位于序列的开头，或者结尾，导致promoter序列（比如1500bp）就没有足够的序列可以提取导致程序报错； 这个脚本比较老了，我们新课程已经更新了这个脚本； https://study.omicsclass.com/index
回答于 2022-08-24 09:46
老师，您好！请问在进行Linux生信分析环境搭建时，输入 sudo mou...
我们已经不用vbox下的biolinux了，用更好的虚拟机docker ： https://www.omicsclass.com/article/1198
回答于 2022-08-23 15:55
如何用Samtools截取保守域序列，老师您之前发的链接里的方法我看...
没法再详细了，看不懂命令，看看视频吧：https://study.163.com/course/introduction.htm?share=2&shareId=400000000234009&courseId=1212025847
回答于 2022-08-23 15:50
关于基因家族分析中可能有问题导致结构无法分析得到的各文件截图
1.不要用记事本编辑文件，会导致linux不兼容。用notepad++等专业的文本编辑软件 2.你的蛋白ID和GFF里面的mRNAID 不一样，一个t1 后缀，一个是 p1 后缀，你想办法统一一下；
回答于 2022-08-22 20:29
在做fst绘图输出，pi多样性绘图输出时，pi_manhattan_plot.r -i...
脚本的最前面有个 export PATH命令没有执行， 每次重启docker之后脚本开头的环境变量要运行一下才行；
回答于 2022-08-22 14:24