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老师，我在基因家族鉴定时，用新生成的hmm文件做hmmsearch时，报...
高版本的hmmsearch 会报这个错误，建议删除这个参数--cut_tc hmmer 3.1b2 不会报错，
回答于 2023-02-22 13:27
老师，根据您的课程分析拟南芥WRKY基因家族，进化树构建时出现No...
可以手动删除一些gap，重新构建进化树：https://www.omicsclass.com/article/221
回答于 2023-02-22 11:51
动植物基因组组装课，脚本文件中sed命令的含义
这里的s$$$ 和s/// 相同的意思，sed 语法只要三个字符一样即可；例如 s###也是可以的； 因为搜索替换的内容里面有/ #等，为了避免歧义用s$$$
回答于 2023-02-20 09:15
kaks批量提取报错
要用我们组学大讲堂基因家族课程里面的paraAT才行，我们对ParaAt.pl脚本做了修改， 如果自己下载的Para AT请查看官方帮助：https://github.com/wonaya/ParaAT 基因家族课程：https://zzw.xet.tech/s/bGBQV
回答于 2023-02-16 16:45
基因家族分析---没有蛋白序列可以做基因家族分析吗？
没有蛋白序列做不了， 我看你有基因组和gff文件，可以通过这两个文件提取基因的cds序列再翻译成蛋白序列，就可以分析基因家族了；
回答于 2023-02-15 17:57
基因组注释解压 database.tar.gz.* 问题
数据下载不完整吧，你重新下载一下试试的。 也可以用md5 值确认一下是否下载完整； 你把你下载的文件都计算一下md5，和百度云盘里面的md5sum.txt 文件里面的值核对一下，一样说明文件完整的，不一样说明文件损坏需要重新下载； 参考这里：https://developer.aliyun.com/article/248659
回答于 2023-02-14 23:33
基因家族物种间共线性，老师，为什么我的物种间共线性分析总是报...
所有的输入文件都检查一下，序列ID和bed里面的ID要一致才行； 你这个只贴了两个bed文件，序列文件没贴，不好帮你检查；
回答于 2023-02-14 14:58