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基因家族分析---没有蛋白序列可以做基因家族分析吗？
没有蛋白序列做不了， 我看你有基因组和gff文件，可以通过这两个文件提取基因的cds序列再翻译成蛋白序列，就可以分析基因家族了；
回答于 2023-02-15 17:57
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基因组注释解压 database.tar.gz.* 问题
数据下载不完整吧，你重新下载一下试试的。 也可以用md5 值确认一下是否下载完整； 你把你下载的文件都计算一下md5，和百度云盘里面的md5sum.txt 文件里面的值核对一下，一样说明文件完整的，不一样说明文件损坏需要重新下载； 参考这里：https://developer.aliyun.com/article/248659
回答于 2023-02-14 23:33
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基因家族物种间共线性，老师，为什么我的物种间共线性分析总是报...
所有的输入文件都检查一下，序列ID和bed里面的ID要一致才行； 你这个只贴了两个bed文件，序列文件没贴，不好帮你检查；
回答于 2023-02-14 14:58
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cafe5 Families with largest size differentials:
作者回复：if families are changing too rapidly, it becomes hard to infer their most likely ancestral state, and therefore whether there have been gains or losses on a specific branch. But if you’d like to get a non-exact idea of what’s going on, you could try analyzing these families while setting l...
回答于 2023-02-11 09:43
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如何获取顺势作用原件分析的gene.bed和feature.bed文件
基因家族 课程里面有讲的，你看看课程：https://study.omicsclass.com/index
回答于 2023-02-10 17:01
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